Экспозиция начинается подборкой экспонатов за разные периоды того времени, когда 11 000 лет назад, в конце Ледникового периода, было образовано первое известное поселение на территории современной Эстонии.
Тематика каменного века заканчивается экспозицией периода ускоренного после освоения человеком металлов развития во время бронзового и железного веков, по шкале времени данный период простирается вплоть до эпохи Великого переселения народов 1500 лет назад.